基因调控网络(gene regulatory network-GRN)分析基础概念
2024年8月21日 · 作者提出了scGEMA模型，一种基于单细胞多组学增强子的基因调控网络推断方法，通过结合单细胞基因表达和染色质可及性谱来推断基因调控网络。该模型能够研究动态生物过程的复杂基因调控机制，如细胞分化和疾病驱动的细胞重塑。
GRNdb: Gene Regulatory Network database
Gene regulatory networks are crucial for understanding the mechanism of gene expression regulation and expression heterogeneity. GRNdb is a freely accessible and user-friendly database for conveniently exploring and visualizing the predicted regulatory networks formed by transcription factors (TFs) and downstream target genes (termed regulons) based on large …
Gene regulatory network inference in the era of single-cell
2023年6月26日 · Gene regulatory networks (GRNs) are interpretable computational models of the regulation of gene expression in the form of networks, mathematically also defined as graphs. Multiple components of ...
Analysis of Gene Regulatory Networks from Gene Expression …
2024年9月20日 · Unraveling the complexities of Gene Regulatory Networks (GRNs) is crucial for understanding cellular processes and disease mechanisms. Traditional computational methods often struggle with the dynamic nature of these networks. This study explores the use of Graph Neural Networks (GNNs), a powerful approach for modeling graph-structured data like GRNs. …
nature reviews genetics | 基因调控网络方法总结 - CSDN博客
2024年10月2日 · 染色质、转录因子和基因之间的相互作用产生了复杂的调控回路，可以把这调控回路表示为基因调控网络 （grn），调控结果的表现形式之一是转录（基因表达）的改变。
单细胞转录组高级分析二：转录调控网络分析 - 腾讯云
组织内细胞异质性的基础是细胞转录状态的差异，转录状态的特异性又是由转录因子主导的基因调控网络（GRNs）决定并维持稳定的。因此分析单细胞的GRNs有助于深入挖掘细胞异质性背后的生物学意义，并为疾病的诊断、治疗以及发育分化的研究提供有价值的线索。
基因调控网络 (Gene Regulatory Network) 01 - Bracer - 博客园
2020年2月15日 · 本文为入门级的基因调控网络文章，主要介绍一些基本概念及常见的GRN模型。 概念： 基因调控网络 (Gene Regulatory Network, GRN)，简称调控网络，指细胞内或一个基因组内基因和基因之间的相互作用关系形成的网络，特指基因调控 (gene regulation) 导致基因之间的作 …
基因调控网络(gene regulatory network-GRN)分析基础概念
2024年8月20日 · 基因调控网络的应用场景： 1、探索特殊的细胞类型和状态的调控网络，比如怎么维持不同细胞亚群的“身份”； 2、探索细胞的随着时间连续的变化，在这种连续变化的过程中，转录因子调控网络会发生什么变化；
RNA 26. SCI文章中基于转录组数据的基因调控网络推断 (GENIE3)
2022年9月23日 · 今天介绍一下基于转录组数据的基因调控网络推断，这里面除了举个简单的例子，还列举一个单细胞转录组的数据，进行基因调控网络推断，效果还是不错的，这样就能够把我们的单细胞数据与bulk的数据结合起来，查缺补漏，使得数据上更加完整，更有说服力！
基因调控网络 - 百度百科
细胞内一组基因之间通过调控rna或蛋白质而建立起来的非直接作用的关系网络。调节网络中基因的转录。
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